Τα θέματα του προϋπολογισμού  των ΑΕΙ  και ο αριθμός των εισακτέων ήταν τα βασικότερα θέματα που συζητήθηκαν στην Σύνοδο των Πρυτάνεων

«Η μείωση του Τακτικού Προϋπολογισμού (ΤΠ) πλέον του 40% στην περίοδο 2010-14 και η περαιτέρω μείωση για το 2015 δημιουργούν συνθήκες ασφυξίας στη λειτουργία των Ιδρυμάτων. Οι προϋπολογισμοί αυτοί δεν επαρκούν για το 2015 και, επομένως, δεν μπορούν να εκτελεστούν αν δεν υπάρξουν σημαντικοί πρόσθετοι πόροι για τα Πανεπιστήμια, όπως έχει δεσμευθεί το Υπουργείο Παιδείας. Ανεξάρτητα από το ύψος των πιστώσεων, ένα μεγάλο και χρόνιο πρόβλημα των Πανεπιστημίων είναι οι διαδικασίες με βάση τις οποίες οι πιστώσεις αυτές διατίθενται στα Ιδρύματα, με συνέπεια την τελική απώλεια πόρων.»  αναφέρουν οι πρυτάνεις

Η Σύνοδος  προτείνει τον ορισμό μιας επιτροπής με εκπροσώπηση των συναρμόδιων Υπουργείων (Παιδείας, Οικονομικών και Ανάπτυξης) και της Συνόδου, η οποία να επεξεργαστεί προτάσεις για την απλοποίηση των διαδικασιών εκτέλεσης των προϋπολογισμών (Τακτικού και Προγράμματος Δημοσίων Επενδύσεων) των Πανεπιστημίων.

Για τις υπηρεσίες καθαριότητας, και φύλαξης των ΑΕΙ  το ψήφισμα των πρυτάνεων αναφέρει ότι «οι  υπηρεσίες καθαριότητας, φύλαξης και συντήρησης είναι σημαντικές για την λειτουργία του Πανεπιστημίου και καλύπτονται με δαπάνες του Τακτικού Προϋπολογισμού, οι οποίες απορροφούν ένα σημαντικό μέρος των συνολικών πόρων. Προτείνεται νομοθετική ρύθμιση, η οποία θα επιτρέπει στα  Πανεπιστήμια να μεταφέρουν συγκεκριμένους πόρους του Τακτικού Προϋπολογισμού στις Εταιρείες Διαχείρισης και Αξιοποίησης Περιουσίας των Ιδρυμάτων, οι οποίες θα έχουν την ευθύνη της διαδικασίας της σύναψης των συμβάσεων για την καθαριότητα, τη φύλαξη και τη συντήρηση των εγκαταστάσεων των Πανεπιστημίων. »

Στην Σύνοδο τους οι πρυτάνεις των ΑΕΙ αναφέρθηκαν και στο θέμα των ΤΕΙ τονίζοντας ότι «η επιχειρούμενη «πανεπιστημιοποίηση» των ΤΕΙ αντιστρατεύεται τους παράλληλους, διακριτούς και νομοθετημένους στόχους των δυο τομέων της ανώτατης εκπαίδευσης, του πανεπιστημιακού και τεχνολογικού. Οι δυο αυτοί τομείς προσφέρουν διαφορετικά αντικείμενα σπουδών, με τα ΤΕΙ να εστιάζουν στην τεχνολογική εκπαίδευση, ενώ τα Πανεπιστήμια να αναπτύσσουν, μεταξύ άλλων, έντονη και συνεχή ερευνητική δραστηριότητα που στηρίζει συστηματικά τους τρεις κύκλους σπουδών. 

Η Σύνοδος Πρυτάνεων κρίνει απαραίτητο να διατηρηθεί η απαραίτητη για την ανάπτυξη της χώρας διακριτή ταυτότητα μεταξύ προγραμμάτων σπουδών των ΤΕΙ και των Πανεπιστημίων καθώς και των αντίστοιχων επαγγελματικών δικαιωμάτων, προκειμένου να αναδειχθεί ο ουσιώδης και βάσει νόμου ρόλος των ΤΕΙ ως πυλώνας της τεχνολογικής εκπαίδευσης».