Πολλοί συμπολίτες μας είναι εκείνοι που αναρωτιούνται πώς και γιατί οι τρούλοι του Αγ. Θεράποντα που ανασκευάζονται, έχουν αλλάξει χρώμα. Μάλιστα επισημαίνουν ότι το αρχικό υλικό που χρησιμοποιήθηκε ήταν λευκό, που μάλιστα έδειχνε από μακριά πως επρόκειτο για μάρμαρο. Αυτό χαρακτήριζε τον ναό και τον ξεχώριζε ως εμβληματικό.
Αναρωτούνται γιατί είναι μαυριδερό, σκούρο γκρι, τονίζοντας ότι και φωτισμός να χρησιμοποιηθεί το σκουρόχρωμο υλικό του δεν το αφήσει να ξεχωρίζει από τα μαύρα βουνά του Χάλικα και του  προφήτη Ηλία.
Στις ανησυχίες των συμπολιτών μας, ο προϊστάμενος της εφορείας αρχαιοτήτων  Λέσβου. Π. Τριανταφυλλίδης, μας καθησυχάζει, τονίζοντας, και διαβεβαιώνοντας μας: ας κάνουμε όλοι λίγο υπομονή. Το υλικό είναι απόλυτα ελεγμένο, απλά απαιτείται κάποιο χρονικό διάστημα για να μπορέσει το υλικό στους τρούλος, να ρθει σε επαφή με τον αέρα, τη βροχή, και γενικά με όλα τα έντονα καιρικά φαινόμενα, και τότε θα πάρει την αρχική του γνώριμη μορφή. Θα μετατραπεί στο λευκό γνώριμο χρώμα, δίνοντάς του την αίγλη του παρελθόντος . Απλά θα απαιτηθούν λίγοι μήνες, μέχρι η φύση να ολοκληρώσει τα έργο της.